A lista de condenações contra Mercial Lima de Arruda é extensa. Com a prestação de contas desaprovadas relativas ao exercício financeiro de 2009, o ex-gestor deve devolver aos cofres públicos a quantia de R$ 3.780.429,11, e pagamento de multas que totalizam R$ 404.442,00. Além disso, diversas irregularidades pesam contra o político, detectadas pelos auditores do Tribunal de Contas do Estado do Maranhão (TCE).
Entre elas estão: ausência de notas fiscais para comprovação de despesas; irregularidades em processos licitatórios, pagamento de fornecedores em desacordo com a legislação vigente; não recolhimento do ISS no valor de R$ 1.639.639,54; irregularidades na execução de obras e serviços de engenharia no valor total de R$ 962.963,26; concessão de subvenções, auxílios e contribuições sem amparo legal e não recolhimento junto ao INSS das contribuições previdenciárias. O ex-prefeito ainda pode recorrer da decisão.